1、屋頂上安裝光伏發電板的前期成本比較高，主要是購買鋼材支架、光伏板組件、直流線、逆變器和一些加固件輔材，暫且先不說人工安裝費用，這樣算下來前期的投資成本也是非常高的，對于普通農戶來說回本周期太長，短時期內很難看到效益。光伏板組件若是出現問題，一般不專業的人進行維修，會顯得比較麻煩，假如請一些專業的光伏后期維護師傅，價格不菲，普通農戶承擔不起，得不償失。

       2、光伏發電是利用光的伏特效應，把太陽能轉化為電能。當陽光充沛的情況下，太陽能電池板發電轉化率就會高一些，反之亦然。所以，多云的時候發電量大于陰雨天，白天發電量大于夜晚，夏天的發電量大于冬天。所以這就導致太陽能光伏板發出來的電量不具有穩定性，時弱時強。相比于火電，穩定性太差，不利于電量的恒定輸出。

       3、在安裝屋頂分布式光伏支架的時候對房屋的建筑結構要求特別高，房屋一定要承受著光伏板組件的重力。支架的安裝需要對屋頂進行打孔、安裝膨脹螺絲釘，加固光伏板的支架。如果購買的支架材質太差，后期光伏板組件有可能從高空飄落下來，砸傷行人。如果在房頂開工不當會導致房屋出現漏水現象。

       4.屋頂面積有限，所以安裝的光伏板組件數量也是有限的，那么光伏板組件發出的電量也是有限的。

       不能夠幾何倍數式的發電，也是屋頂分布式光伏發電的短板。